독도·동해관련 고지도는 재단 독도연구소에서 수집한 독도·동해 관련 각종 지도를 모아서 제공하는 자료이다. 재단은 동·서양의 고지도 중에서 독도와 동해표기 관련된 고지도를 지속적으로 수집하고 있다. 현재까지 수집된 자료를 디지털화하고, 해제를 더하여 서비스를 제공하고 있으며, 아울러 서울대 규장각한국학연구원과 국립중앙도서관 소장 고지도 중에서 독도와 동해표기 관련 지도를 연계하여 통합서비스를 하고 있다.