1980년부터 2018년까지 28번의 여름 발굴조사 기간에 걸쳐 53개 구역에서 실시된 크라스키노성에서의 발굴조사는 몇몇 지점에 집중되어 실시되었다. 발굴조사 지역은 크게 성 내의 서북지역 북부 사찰구역, 서북지역 남부 주거구역, 서북지역 동부 일대, 서북지역 동북부 일대, 중북지역 주거구역, 중북지역 북부 일대, 중남지역 광장 일대, 동문지 일대로 각각 구분된다. 그 외에 도로가 조사된 서북지역 서부 도로구역(제51구역)이 있다.